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Servicios

Proteómica

La Unidad de Proteómica del IMIBIC proporciona a los investigadores acceso a los últimos avances en el área. En concreto, la Unidad de Proteómica es una plataforma especializada en proteómica cuantitativa y en MALDI Imaging.

La Unidad de Proteómica pertenece a la Plataforma de Proteómica en red del Carlos III, ProteoRed, y ofrece servicios analíticos a la comunidad científica del IMIBIC y de la Universidad de Córdoba, pero también a otras universidades, hospitales y empresas.

La Unidad tiene dos líneas principales: (i) una plataforma de cromatografía líquida-espectrometría de masas (LC-MS) para la realización de análisis proteómicos a gran escala, abarcando desde servicios de identificación y caracterización de proteínas hasta proteómica cuantitativa de tipo label-free y DIA (data-independent acquisition); y (ii) una plataforma de imagen molecular basada en espectrometría de masas (MALDI Imaging) que proporciona información sobre la situación de lípidos y proteínas directamente sobre tejidos y biopsias.

Como servicio de apoyo a la actividad investigadora, la Unidad de Proteómica proporciona soporte individualizado, incluyendo ayuda en la redacción de proyectos y diseño de experimentos, preparación de muestras, análisis por espectrometría de masas y análisis de los datos generados.

Personal

Ignacio Ortea García, PhD
e-mail: ignacio.ortea@imibic.org
Teléfono: (+34): 957 213 757

Eduardo Chicano Gálvez, PhD
e-mail: eduardo.chicano@imibic.org
Teléfono: (+34): 957 213 757

Equipamiento

  • Espectrómetro de masas Q-TOF, Triple TOF 5600+ (Sciex).
  • Espectrómetro de masas triple cuadrupolo, XevoTQ-S (Waters).
  • Espectrómetro de masas MALDI-TOF/TOF, 5800 (Sciex).
  • nanoHPLC: Eksigent LC400 (Sciex).
  • nanoUPLC: nanoAcquity M-Class (Waters).
  • Sprayer: Sunchrom Suncollect (Sunchrom, Friedrichdorf, Germany).
  • Principales programas utilizados para análisis de datos: Protein Pilot, Comet y X!Tandem para identificación de proteínas; Peak View, Marker View y Skyline para proteómica cuantitativa; Tissue View, MSiReader y Cardinal para MALDI Imaging MS.
  • Equipamiento de laboratorio básico para preparación de muestras.

Cartera de servicios

En breve, la Unidad de Proteómica ofrece los siguientes servicios:

  • Identificación y caracterización de proteínas por MALDI-TOF/TOF.
  • Identificación y caracterización de proteínas por LC-MS/MS.
  • Proteómica cuantitativa:
    • SWATH (Data-Independent Acquisition).
    • SRM (Selected Reaction Monitoring)/pseudoSRM.
  • MALDI Imaging mass spectrometry.
  • Revisión de propuestas a convocatorias de proyectos.
  • Colaboración en proyectos de investigación.
  • Formación en el software utilizado para análisis de datos.

Nuestras tarifas pueden incluir todo (incluyendo preparación de muestras y análisis de datos) o únicamente el análisis por espectrometría de masas. Hacer la preparación de muestras y el análisis de datos por ti mismo hará que el análisis te salga más barato, y una vez que aprendas a hacerlo (te podemos enseñar) serás capaz de interrogar a tus datos en mucha más profundidad de lo que nosotros podemos.

Dirección postal

Unidad de Proteómica
Hospital Universitario Reina Sofía
Edificio IMIBIC
Av. Menéndez Pidal s/n
14004 Córdoba, ESPAÑA

Acceso rápido a servicios