El Instituto plantea la formación como instrumento institucional básico e indispensable para alcanzar los objetivos científicos del mismo, para ello propone un plan dirigido al fomento del conocimiento y a la adecuación de las líneas de investigación actuales. El coordinador de Formación es el Prof. Dr. Eduardo Collantes Estévez.
El IMIBIC lidera un Programa de Doctorado único en Investigación Biomédica, que ha sido recientemente acreditado, y en el que se ha integrado el Programa de Doctorado de Nutrición y progresivamente lo hará el de Metodología de la Investigación en Ciencias de la Salud. Este nuevo Programa de Doctorado en Biomedicina, coordinado por el Prof. Dr. Francisco Gracia Navarro, contribuirá a facilitar una formación avanzada orientada a cualificar recursos humanos, que impulsen la docencia y la investigacion, y que favorezca la cualificación profesional en el campo de las ciencias biomédicas, y por tanto en el ámbito del IMIBIC.